新疆北疆区域羊肠道病毒分子流行病学调查及遗传进化分析

摘要

羊肠道病毒(CEV)主要感染山羊或绵羊消化系统、呼吸系统及神经系统，本研究旨在了解该病毒在新疆北疆区域的流行情况。采用逆转录PCR(RT-PCR)对新疆北疆5个地州213份绵羊粪便样品进行CEV病原学检测，分析CEV感染情况及不同因素对其阳性率的影响，对部分阳性样品CEV 5′-UTR序列测序并进行遗传进化分析。结果：北疆区域绵羊CEV总阳性率为39.4%(84/213),5个地州CEV阳性率在15.0%～69.0%;圈养模式比散养模式的CEV阳性率高22.8个百分点，腹泻比非腹泻羊群CEV阳性率高19.2个百分点；CEV与星状病毒、腺病毒混合感染率达33.8%。同源性及遗传进化显示，鉴定的7株CEV 5′-UTR基因均属于EV-G种，同源性介于81.2%～97.1%,且在进化树上聚为一支。综上，北疆区域绵羊存在CEV感染，并从分子水平上证实其流行毒株为EV-G种，CEV可能是导致绵羊腹泻的重要病原，其阳性率高低与养殖模式相关。

关键词

羊肠道病毒 / 绵羊 / 新疆 / 分子流行病学 / 遗传进化

基金资助

国家重点研发计划项目(2023YFD1801302); 江苏省重点研发项目(BE2022330); 兽医生物技术国家重点实验室开放基金项目(SKLVBF202106)