一种多视角图嵌入的miRNA-疾病关系预测方法

摘要

MicroRNA(miRNA)在人类复杂疾病的发生发展中发挥着重要作用.由于生物学实验耗时费力，开发一种准确的计算预测方法对于识别疾病相关的miRNA是必不可少的.本文提出了一种多视角图嵌入的miRNA-疾病关联识别新方法(MGEMDA).该方法首先构建miRNA与疾病的多个相似网络，表征miRNA与疾病的关系.其次引入混合图表示学习框架，同时学习miRNA和疾病的特征.最后将特征输入到神经归纳矩阵补全模型中进行miRNA-疾病关联预测.在5折交叉验证中AUC值达到0.9454,与现有几种最先进的方法相比具有优异的性能.此外，对3种疾病(结肠癌、肺癌、乳腺癌)的案例研究进一步证实了MGEMDA对潜在疾病相关miRNA的预测能力.

关键词

miRNA-疾病关联预测 / 多视角相似性网络 / 图卷积网络 / 图注意力网络