应用孟德尔随机化方法识别2型糖尿病的因果基因

摘要

全基因组关联研究（GWAS）能够系统地鉴定与性状和疾病相关的遗传位点。然而，基于GWAS数据识别与疾病显著相关的遗传变异位点和风险基因仍然具有挑战性。本研究通过将GWAS与剪接数量性状位点（sQTL）和表达数量性状位点（eQTL）数据整合，旨在识别2型糖尿病（Type 2 diabetes mellitus,T2DM）的因果基因。基于IEU Open GWAS Project数据库中T2DM的GWAS数据，以及GTEx数据库中49种组织的sQTL和eQTL数据，应用基于汇总数据的孟德尔随机化（SMR）和异质性检验（HEIDI）方法进行共定位分析，鉴定了潜在风险基因，并通过基因的差异表达分析和功能注释探索了其生物学功能。结果表明，4个基因与T2DM的遗传变异显著相关，且在不同组织中发挥重要作用，为T2DM的遗传机制提供了新见解。

关键词

2型糖尿病 / 因果基因 / 孟德尔随机化 / 分子数量性状位点