基于生物信息学对肺腺癌核心基因的预测及验证

摘要

目的：基于生物信息学对肺腺癌核心基因进行预测及验证。方法：采用GEO数据库收集肺腺癌数据集，采用R软件处理，收集36例肺腺癌患者的肿瘤组织样本及邻近正常肺组织样本并验证表达水平。结果：差异表达基因主要富集于卷曲结合、糖胺聚糖结合、肝素结合和细胞外基质结构成分，Wnt信号通路、ecm-受体相互作用、肿瘤蛋白多糖三条通路与之密切相关。7个核心基因中，5个基因的表达水平具有统计学意义，分别是PPBP、ADRA1B、CDCA8、CENPA和NMUR1。结论：PPBP、ADRA1B、CDCA8、CENPA和NMUR1基因可能是肺腺癌潜在生物标志物。

关键词

肺腺癌 / 生物信息学 / GEO数据库 / 差异表达基因

基金资助

福建医科大学启航基金项目（编号：2019QH1166）