基于TCGA-BLCA蛋白组学数据的膀胱癌预后标志物鉴定与验证

摘要

目的：基于癌症基因组图谱-膀胱尿路上皮癌（TCGA-BLCA）蛋白组学数据筛选并验证膀胱癌预后相关蛋白标志物，构建预后预测模型。方法：从UCSC Xena数据库获取TCGA-BLCA队列蛋白组表达数据和临床信息，纳入349例膀胱癌患者。采用单因素Cox回归筛选生存相关蛋白，运用Lasso回归进行特征选择，通过多因素Cox回归构建预后模型。采用Kaplan-Meier生存分析和受试者工作特征曲线（ROC）评估模型性能。运用GSVA分析通路差异，采用onco Predict预测化疗药物的敏感性。结果：筛选出33个生存相关蛋白，最终确定Rad51-M-E、Src-M-V和Annexin-1-M-E为独立预后预测因子。基于三个蛋白的风险模型能有效区分高风险与低风险患者（P<0.001），具有良好的预测性能。氧化应激通路在高风险患者与低风险患者之间差异显著。预后蛋白与多种化疗药物敏感性显著相关。结论：基于TCGA-BLCA蛋白组学数据，成功建立了基于Rad51-M-E、Src-M-V和Annexin-1-M-E的膀胱癌预后预测模型，且模型对膀胱癌预后具有良好的预测性能。

关键词

膀胱癌 / 蛋白组学 / 预后标志物 / 癌症基因组图谱