《福州大学学报（自然科学版）》是由福建省教育厅主管、福州大学主办的自然科学类综合性学术期刊，主要刊载校内作者之基础科学和工程技术领域的最新科研成果，及部分校外学者的国家级项目研究成果。于1961年11月创办，前身为《福州大学学报》。创刊初期为不定期出版，1966~1977年间停刊，1978年复刊后仍为不定期出版，1982年起公开正式出版发行，季刊。1985年更名为《福州大学学报（自然科学版）》，仍为季刊，1993年起转为双月刊至今。国内统一刊号为CN35-1337/N，国际标准刊号（ISSN）为1000-2243，国际刊名代码（CODEN）为FDXKEN。