黄颡鱼硒蛋白基因的克隆与分析

华中农业大学学报 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (01) : 185 -193.

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华中农业大学学报 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (01) : 185 -193. DOI: 10.13300/j.cnki.hnlkxb.2024.01.021

黄颡鱼硒蛋白基因的克隆与分析

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摘要

为探讨黄颡鱼硒蛋白selenow2a、selenop2和selenot2基因之间的关系,采用3'/5' RACE PCR克隆得到3个基因的cDNA全长,分别为891、1 998和1 432 bp,其中ORF长度分别为288、828和600 bp,编码95、275和219个氨基酸。在线工具SECISerach3对3个基因的cDNA序列分析结果显示,它们都含有可以编码硒代半胱氨酸的终止密码子,以及在3'非编码区存在SECIS元件。通过氨基酸序列比对和系统发育树分析,发现selenow2a、selenop2和selenot2基因预测得到的氨基酸序列与斑马鱼(Danio rerio)氨基酸相似性分别为82.24%、66.19%和79.45%,而与斑点叉尾鮰(Ictalurus punetaus)的氨基酸相似性分别为94.74%、68.50%和90.95%,在发育树上则显示为树杈相接近。采用实时荧光定量PCR检测3个硒蛋白基因的mRNA在黄颡鱼心脏、肝脏、肌肉、脑、肠、脾脏、精巢和卵巢组织中的表达,结果显示其mRNA表达水平呈现组织特异性。表明3个基因拥有硒蛋白家族的特征,但在组织表达上具有特异性。

关键词

硒蛋白 / 基因克隆 / 分子特征 / 黄颡鱼 / 组织表达

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黄颡鱼硒蛋白基因的克隆与分析[J]. 华中农业大学学报, 2024, 43(01): 185-193 DOI:10.13300/j.cnki.hnlkxb.2024.01.021

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