4类食用菌中RNA病毒的检测和种类分析

摘要

为明确生产中不同食用菌中的病毒种类，采用高通量测序技术，对53株侧耳属(Pleurotus spp.)和10株灵芝属(Ganoderma spp.)，以及17株金针菇(Flammulina filiformis)和12株鸡腿菇(Coprinus comatus)的菌株中的真菌病毒进行检测，对新发现的可能新病毒进行PCR扩增和序列分析，在序列比较的基础上进行系统发育树分析。BLASTx序列比对分析结果显示，4类92个食用菌菌株共有51条contigs可注释为41种病毒，RT-PCR扩增和序列分析共鉴定到13种可能的新病毒，其中，侧耳属菌株中发现7种，鸡腿菇中发现3种，金针菇中发现1种，灵芝属菌株中发现2种。系统发育分析结果显示，这些病毒分属于+ssRNA病毒、-ssRNA病毒和dsRNA病毒，分布在8个病毒科，包括Barnaviridae、Botourmiaviridae、Deltaflexiviridae、Mymonaviridae、Partitiviridae、Phenuiviridae、Phlegiviridae和1个未分类的Bunyavirales病毒。研究结果表明：4类食用菌中存在较为丰富的真菌病毒。

关键词

食用菌 / 侧耳属 / 灵芝属 / 鸡腿菇 / 金针菇 / 真菌病毒 / 病毒检测