莴苣全基因组InDel标记开发及应用

唐丹; 涂艺义; 黄展倩; 肖慧玲; 朱雪冰; 王昕; 陈炯炯

doi:10.13300/j.cnki.hnlkxb.2026.02.011

华中农业大学学报 ›› 2026, Vol. 45 ›› Issue (2) : 99 -112. DOI: 10.13300/j.cnki.hnlkxb.2026.02.011

莴苣全基因组InDel标记开发及应用

唐丹, 涂艺义, 黄展倩, 肖慧玲, 朱雪冰, 王昕, 陈炯炯

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摘要

为明确莴苣主要栽培类型（结球生菜、油麦菜、莴笋）的品种遗传差异并解决同物异名问题，通过比对生菜Salinas与莴笋YL1的基因组序列，在全基因组范围鉴定出23 901个潜在InDel位点；随机选取80个位点设计引物，在6份莴笋和6份生菜中进行PCR筛选，获得42个稳定多态性标记，并进一步对57份商品品种（10份结球生菜、24份莴笋、23份油麦菜）进行基因型分析。结果显示，42个标记中14个适用于结球生菜区分，17个适用于莴笋，35个适用于油麦菜；10份结球生菜被划分为8组，24份莴笋划分为20组，23份油麦菜划分为12组，品种间存在遗传差异及同物异名现象。结果表明，该InDel标记体系可直接用于莴苣品种快速鉴定与遗传背景厘清。