基于网络药理学与分子对接技术探讨柴胡-白芍治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制

摘要

目的 采用网络药理学及分子对接技术探讨柴胡-白芍对慢性萎缩性胃炎（CAG）的作用机制。方法 借助TCMSP平台筛选柴胡-白芍的活性成分和作用靶点，并借助GeneCards、TTD、OMIM数据库筛选CAG的疾病靶点，将药对作用靶点与疾病靶点取交集，得到交集靶点并绘制Venn图。借助Cytoscape 3.9.1软件构建中药-活性成分-交集靶点的可视化网络，筛选度值排名前五的活性成分，即为主要活性成分；借助String数据库对交集靶点进行蛋白交互分析，并构建PPI网络图，筛选度值排名前五的即为核心靶点；同时通过David数据库对交集靶点进行GO功能[包括生物过程（BP）、细胞组分（CC）、分子功能（MF）]和KEGG通路富集分析；将主要活性成分与核心靶点进行分子对接，验证二者结合的稳定性，以结合能<-5.0 kcal/mol认为二者存在良好的结合活性。结果 共获取柴胡-白芍药对的活性成分19个，对应的药物作用靶点190个，CAG疾病靶点972个，二者的交集靶点87个；其中排名前五的活性成分是槲皮素、山柰酚、异鼠李素、β-谷甾醇、豆甾醇；核心靶点是AKT1、JUN、TNF、CASP3、IL-6;GO功能分析结果显示：BP共富集到557个条目，CC共富集到61个条目，MF共富集到100个条目。其中BP主要涉及基因表达的正向调控、凋亡过程的负向调控、对外源性刺激的反应、对脂多糖的反应等；CC主要涉及细胞外空间、胞液、含蛋白复合物、细胞浆等；MF主要涉及酶结合、相同的蛋白质结合、蛋白质结合、泛素蛋白连接酶结合等；KEGG通路富集分析共获取158条通路，包括癌症通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等；分子对接显示主要活性成分与核心靶点的结合能均≤-5 kca/mol，提示二者结合稳定，其中以槲皮素、山柰酚、异鼠李素与AKT1、CASP3结合较为稳定。结论 柴胡-白芍药对可能通过槲皮素、山柰酚、异鼠李素、β-谷甾醇、豆甾醇等主要活性成分作用于AKT1、JUN、TNF、CASP3、IL-6等核心靶点，调控IL-17、TNF信号通路发挥免疫作用，从而修复胃黏膜防御因子，达到治疗CAG的目的。

关键词

慢性萎缩性胃炎 / 柴胡 / 白芍 / 网络药理学 / 分子对接

基金资助

国家自然科学基金面上项目（81873237）; 福建省自然科学基金面上项目（2021J01929）; 第五批全国中医临床优秀人才研修项目（国中医药人教函[2022]239号）