百香果JAZ基因家族的鉴定及表达模式分析

龚凤鲜, 欧阳浩, 彭昌杨, 姜雨欣, 詹爱萍, 胡小京, 刘增亮, 陈孝玉龙

贵州大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 41 ›› Issue (06) : 106 -117.

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贵州大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 41 ›› Issue (06) : 106 -117. DOI: 10.15958/j.cnki.gdxbzrb.2024.06.16

百香果JAZ基因家族的鉴定及表达模式分析

    龚凤鲜, 欧阳浩, 彭昌杨, 姜雨欣, 詹爱萍, 胡小京, 刘增亮, 陈孝玉龙
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摘要

JAZ(jasmonate ZIM-domain, JAZ)蛋白是一类茉莉酸途径的调节因子,通过与其他信号通路相关成员互相作用,共同调节植物各类重要生命活动。为更好地了解JAZ基因家族在百香果(Passiflora edulis Sims)中系统表征并预测基因功能,本研究通过生物信息学方法对百香果JAZ基因鉴定并对其基因特征、系统进化、表达模式等进行了系统分析。结果表明:百香果全基因组编码12个JAZ基因不均匀地分布在4条染色体上,隶属6个亚家族(Group I—VI);进化分析表明,PeJAZ基因的扩增主要归因于片段复制事件;蛋白互作预测分析表明,PeJAZs蛋白具有功能多样性;转录组测序技术分析揭示了PeJAZ基因不同组织和不同胁迫下具显著的表达差异;值得关注的是,PeJAZ3可能是协助百香果抗病毒的一个潜在基因。上述发现可为进一步研究PeJAZs功能和调控机制提供了基础。

关键词

百香果 / JAZ基因家族 / 生物信息学分析

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百香果JAZ基因家族的鉴定及表达模式分析[J]. 贵州大学学报(自然科学版), 2024, 41(06): 106-117 DOI:10.15958/j.cnki.gdxbzrb.2024.06.16

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