体外培养小鼠坐骨神经在沃勒变性早期的差异表达基因转录组分析

摘要

目的:分析小鼠坐骨神经体外沃勒变性(WD)早期施万细胞(SCs)的差异表达基因及其相关功能通路。方法:取成年雄性C57BL/6J小鼠坐骨神经进行体外WD,并分别于变性后3 h和6 h,提取总RNA并进行转录组测序。通过生物信息学对测序结果进行差异表达基因(DEGs)分析、基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:与对照组比较，体外WD 3 h组(WD3h)和6 h组(WD6h)筛选出的DEGs分别为3961个和5538个。表达上调最为显著的基因主要包括与炎症和免疫相关的分子和神经营养因子。GO分析提示两组的DEGs均富集在正向转录调控及代谢过程。KEGG通路富集分析揭示DEGs主要集中在TNF信号通路、MAPK信号通路以及核糖体生成。结论:在WD早期坐骨神经中的SCs上调与炎症和免疫相关的基因促进WD进程，分泌神经营养因子支持神经元存活，同时伴随TNF信号通路和MAPK信号通路的激活。

关键词

周围神经损伤 / 沃勒变性 / 转录组分析 / 小鼠