不同16S rRNA引物在溺死组织气单胞菌检测中的性能评估

摘要

目的 分析16S rRNA V3区引物、V4区引物和V3-V4区引物检测溺死组织中气单胞菌的差异。方法 采用PCR-扩增子测序方法，评估3种16S rRNA引物在5例溺死者的11个脏器中检测细菌DNA的能力，特别是气单胞菌DNA的检测效果。结果 相比于其他2个引物，V3引物在检测细菌分类操作单元(Operational Taxonomic Unit, OTU)方面更具优势，检测到的细菌OTU数量更多。测序结果分析表明，V3引物能够检测更丰富的细菌门(Phylum)和科(Family),以及更多的气单胞菌。结论 16S rRNA V3引物在检测溺死脏器中的气单胞菌可能更具优势，对溺死诊断具有潜在应用价值。

关键词

溺死 / 16S rRNA测序 / 气单胞菌

基金资助

山东省重点研发计划(重大科技创新工程)项目(2021CXGC011305); 济宁医学院大学生创新创业训练计划项目(cx2023122z)