肝细胞癌复发进程中DNA修复调节的蛋白质组学分析及验证

摘要

目的 分析肝细胞癌（HCC）复发进程中DNA修复调节的作用及机制。方法 串联质量标签（TMT）标记的定量蛋白质组学方法分析HCC 2年内复发和5年预后良好的肝癌组织样本，分析富集在DNA复制、错配修复、碱基切除修复、核苷酸切除修复4条通路的蛋白表达差异，分析在HCC复发进程中起主要作用的调控通路及靶点，预测可能的调控机制。计量资料2组间比较采用成组t检验；多组间比较采用单因素方差分析，进一步两两比较采用LSD-t检验。结果 真核生物复制复合体通路MCM2(P=0.018)、MCM3(P=0.047)、MCM4(P=0.014)、MCM5(P=0.008)、MCM6(P=0.006)、MCM7(P=0.007)、PCNA(P=0.019)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、LIG1(P=0.042)蛋白表达均显著降低；核苷酸切除修复通路中PCNA(P=0.019)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、LIG1(P=0.042)共4个蛋白表达水平均显著减少；碱基切除修复通路PCNA(P=0.019)和LIG1(P=0.042)在HCC复发组中均显著降低；错配修复富集通路中MSH2(P=0.026)、MSH6(P=0.006)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、PCNA(P=0.019)、LIG1(P=0.042)共6个蛋白在肝癌复发组织中均显著减少。差异蛋白涉及MCM复合体、DNA聚合酶复合体ε、连接酶LIG1、长补丁碱基剪切修复复合体（long patch BER）、DNA错配修复蛋白复合体的重要组分。对DNA修复调节的重要差异蛋白进行临床样本验证分析，结果表明复发组中除MCM6表现出下降趋势外，MCM5(P=0.008)、MCM7(P=0.007)、RCF4(P=0.002)、RCF5(P<0.001)和MSH6(P=0.006)蛋白相对表达量均显著降低。结论 HCC复发过程中，DNA修复进程中多个复合体蛋白组分存在显著减少或缺失。

关键词

癌,肝细胞 / 肿瘤复发,局部 / DNA修复 / 蛋白质组学

基金资助

四川省自然科学基金（2022NSFSC1415）; 四川省中医药管理局专项课题（2020JC0124）; 西部战区总医院应用基础研究项目（2021-XZYG-C22,2021-XZYG-C21）;西部战区总医院星火青年创新人才工程