基于监督学习的蛋白质络合物抽取方法

唐楠; 杨志豪; 吴佳金; 王艳华; 林鸿飞

doi:10.16088/j.issn.1001-6600.2011.02.045

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2011, Vol. 29 ›› Issue (02) : 174 -179. DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2011.02.045

基于监督学习的蛋白质络合物抽取方法

唐楠, 杨志豪, 吴佳金, 王艳华, 林鸿飞

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摘要

蛋白质关系网络中存在着大量的蛋白质络合物,络合物对有利于深入探索生物细胞的组织原理和功能有着重要意义。然而传统的络合物发现算法多基于网络的拓扑结构,没有融合络合物本身的结构信息。针对这个问题,提出了监督学习的络合物发现方法,将多种能够标示络合物的信息作为特征,使用监督学习方法对样本集进行训练,将训练得到的模型应用在络合物发现算法中。实验证明,该方法能有效地从蛋白质关系网络中发现络合物。