基于监督学习的蛋白质络合物抽取方法

摘要

蛋白质关系网络中存在着大量的蛋白质络合物,络合物对有利于深入探索生物细胞的组织原理和功能有着重要意义。然而传统的络合物发现算法多基于网络的拓扑结构,没有融合络合物本身的结构信息。针对这个问题,提出了监督学习的络合物发现方法,将多种能够标示络合物的信息作为特征,使用监督学习方法对样本集进行训练,将训练得到的模型应用在络合物发现算法中。实验证明,该方法能有效地从蛋白质关系网络中发现络合物。

关键词

蛋白质关系网络 / 蛋白质络合物 / 监督学习

基金资助

国家自然科学基金资助项目(60673039,61070098); 国家“863”计划资助项目(2006AA01Z151); 高等学校博士学科点专项科研基金资助项目(20090041110002); 中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(DUT10JS09); 辽宁省博士启动基金资助项目(20091015)