翘嘴鳜线粒体基因组全序列的克隆与特征分析

陈敦学; 李玉珑; 宾石玉; 农小献; 刘希良; 成嘉; 张建社; 褚武英

doi:10.16088/j.issn.1001-6600.2011.04.018

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2011, Vol. 29 ›› Issue (04) : 111 -116. DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2011.04.018

翘嘴鳜线粒体基因组全序列的克隆与特征分析

陈敦学, 李玉珑, 宾石玉, 农小献, 刘希良, 成嘉, 张建社, 褚武英

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摘要

通过直接测序的方法获得翘嘴鳜线粒体DNA基因组全序列(GenBank:JF972568)。翘嘴鳜线粒体基因组全长为16 496 bp,其包含13个编码蛋白基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个Control region区域。整个翘嘴鳜线粒体DNA利用率非常高,仅仅只有32 bp的基因间隔和35 bp的基因重叠。翘嘴鳜线粒体的编码蛋白基因具有明显的A+T偏好性,同时整个基因组中G碱基含量非常低,仅有16.2%。翘嘴鳜线粒体基因起始密码子以ATG为主,但终止密码子却呈现多样性。翘嘴鳜22个tRNA基因只有tRNA-leu(UUR、CUN)和tRNA-Ser(UCN、AGY)有2个密码子,22个tRNA按位置可分为3个基因簇(IQM、WANCY、HSL)。翘嘴鳜rRNA的位置和大小与其他鱼类相似,D-Loop区域具有明显的A+T碱基偏好性。翘嘴鳜线粒体全序列的克隆对进一步确定鳜类分类地位和多样性保护具有重要意义。