沙田柚S-RNase基因的克隆及序列分析

秦新民; 张渝; 刘玉洁; 郭丹妮; 李惠敏

doi:10.16088/j.issn.1001-6600.2015.01.023

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2015, Vol. 33 ›› Issue (01) : 139 -145. DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2015.01.023

沙田柚S-RNase基因的克隆及序列分析

秦新民, 张渝, 刘玉洁, 郭丹妮, 李惠敏

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摘要

利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序。通过差异分析得到沙田柚S-RNase基因序列。该基因全长为1 238bp(GenBank登录号为KP172529),开放阅读框(ORF)全长为834bp,共编码278个氨基酸,编码的蛋白质的相对分子质量为31.402kDa,理论等电点为5.30。S-RNase蛋白为亲水性蛋白,共有17个可能的磷酸化位点。氨基酸序列分析表明,其编码的氨基酸与柚Citrus maxima、沙糖桔Citrus reticulata和甜橙Citrus sinensis的同源性分别为99%、98%和96%。系统进化树显示沙田柚S-RNase基因与柚、沙糖桔和甜橙亲缘关系很近,属于同一进化分支。