沙田柚WRKY转录因子的克隆与序列分析

张渝; 刘玉洁; 郭丹妮; 覃信梅; 韩愈; 李惠敏; 秦新民

doi:10.16088/j.issn.1001-6600.2016.03.019

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2016, Vol. 34 ›› Issue (03) : 131 -137. DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2016.03.019

沙田柚WRKY转录因子的克隆与序列分析

张渝, 刘玉洁, 郭丹妮, 覃信梅, 韩愈, 李惠敏, 秦新民

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摘要

利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,差异分析得到沙田柚WRKY转录因子的序列。该基因的全长序列为1 178bp(GenBank accession No.KU173833),含有993bp的开放阅读框(ORF)可编码330个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量为37.00ku,理论等电点为5.79。与未授粉的花柱相比,沙田柚异花授粉1、2、3d花柱中WRKY转录因子基因的表达量(RPKM)分别为5.67、26.04、17.08;而自花授粉1、2、3d花柱中WRKY转录因子基因的表达量(RPKM)分别为15.67、14.96、3.89。氨基酸序列分析表明,该氨基酸序列与甜橙、金桔的同源性分别为98%、97%。系统进化分析发现沙田柚WRKY转录因子与甜橙、金桔的亲缘关系很近,属于一个分支。