波纹鳜线粒体基因克隆及系统发育信息分析

杨丹丹; 谢永广; 宾石玉; 罗华辉; 安苗; 陈敦学

doi:10.16088/j.issn.1001-6600.2019.04.015

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2019, Vol. 37 ›› Issue (04) : 119 -126. DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2019.04.015

波纹鳜线粒体基因克隆及系统发育信息分析

杨丹丹, 谢永广, 宾石玉, 罗华辉, 安苗, 陈敦学

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摘要

为了探讨鳜类线粒体基因组结构特征及系统发育信息,以期为鳜类遗传学研究和分子标记提供参考依据,本文将波纹鳜Siniperca undulata线粒体随机切割成长度为1～3 kb的15个片段,采用PCR产物直接测序法获得波纹鳜线粒体全基因组,并提交至NCBI数据库,获得登录号KJ644783。结果分析发现:波纹鳜线粒体包含13个编码蛋白基因、22个tRNA、2个rRNA以及一个超变区(D-loop),基因排列顺序与其他硬骨鱼类似,不存在基因重排现象。整个基因组存在明显的AC偏好性,其中G碱基含量非常低,仅仅为16.23%。系统发育信息分析结果显示,CO1、ND5、CYTB、ND4基因具有较好的进化适应性,能够较好地反映鳜类的系统发育关系。进一步的进化分析显示,鳜类分成了鳜属和少鳞鳜属。