基于SSR分析广东罗坑鳄蜥饲养种群的遗传结构

何南; 张小丽; 陈宁; 陈泽柠; 武正军

doi:10.16088/j.issn.1001-6600.2021033101

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2022, Vol. 40 ›› Issue (04) : 180 -187. DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2021033101

基于SSR分析广东罗坑鳄蜥饲养种群的遗传结构

何南, 张小丽, 陈宁, 陈泽柠, 武正军

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摘要

鳄蜥Shinisaurus crocodilurus是我国珍稀濒危物种，目前个体数目较少，人工繁殖个体容易发生近亲繁殖现象，因此了解它们的遗传结构有利于避免在饲养条件下发生近亲繁殖。本研究以9对微卫星作为分子标记，对罗坑人工饲养群体的112个鳄蜥进行种群遗传结构分析，结果表明：1) 9对SSR位点总共有106个等位基因(Na),均值12。2)Hardy-weinberg平衡检验的数值范围为0.314～0.998,平衡检验系数均大于0.05。3)9个位点的观测杂合度(Ho)波动范围为0.018～0.929,均值0.629,期望杂合度(He)的范围为0.018～0.851,均值0.622。4)利用MEGA软件基于Nei?s遗传距离构建的邻接进化树(neighbor-joining tree)显示，112个个体划分为2个主支系，第一主支系分成3小支系，第二主支系分成5小支系，分支中的个体亲缘关系较近。5)瓶颈效应检测结果显示，在TPM和SMM模型下，罗坑鳄蜥饲养种群在近期历史上经历了显著的瓶颈效应。在整体水平上，罗坑人工饲养鳄蜥群体遗传多样性贫乏，建议在今后的饲养管理过程中根据邻接进化树将亲缘关系较近的个体分开饲养，避免个体近亲繁殖，维持种群的遗传多样性。