利用改良的CRISPR/Cas9系统构建猪PPARD 载体及效率检测

吴雅婕; 杨跃飞; 范博钧; 徐磊; 鞠辉明

doi:10.16088/j.issn.1001-6600.2022121803

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2023, Vol. 41 ›› Issue (06) : 132 -138. DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2022121803

利用改良的CRISPR/Cas9系统构建猪PPARD 载体及效率检测

吴雅婕, 杨跃飞, 范博钧, 徐磊, 鞠辉明

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摘要

为了构建猪PPARD基因编辑载体并进行基因编辑效率检测，本研究利用改良的双位点编辑CRISPR/Cas9载体系统，根据PPARD基因结构和序列特点，设计2个能靶向切割PPARD基因的sgRNA序列，将2个PPARD sgRNA表达盒以串联的形式连接到一个CRISPR/Cas9载体中。将构建的质粒转染PK15细胞，提取各组细胞DNA,PCR扩增突变区域后，通过序列测定在DNA水平检测载体编辑效率。分别提取各组细胞总RNA及细胞总蛋白，利用qRT-PCR及Western blot在基因表达及蛋白表达水平上检测重组载体的基因编辑效率。结果发现，PPARD-2KO组DNA总突变率为45.83%(22/48);与正常对照组相比，PPARD基因编辑组中PPARD mRNA显著下降84%(P<0.01),PPARD蛋白表达量显著下降61%(P<0.01)。本研究利用改良的CRISPR/Cas9载体系统成功构建了高效PPARD基因编辑载体，并且未经药物筛选即可在细胞上实现高效率基因编辑，将大幅提高后续筛选单细胞克隆效率，推进对PPARD基因的功能研究。