东北地区3种啮齿动物肠道病毒组成的比较研究

摘要

棕背■Myodes rufocanus、大林姬鼠Apodemus peninsulae和黑线姬鼠Apodemus agrarius是东北地区主要的3种害鼠。动物肠道微生物伴随宿主进化与其胃肠道构成了复杂的微生态系统，并在肠道内发挥着重要作用。为研究3种啮齿动物肠道病毒组成及亲缘关系和生境2种因素对其的影响，本研究对在同一生境下的17只大林姬鼠、17只棕背■以及另一生境中的9只黑线姬鼠肠道内容物样本进行宏基因组测序，对3种啮齿动物的肠道病毒组成及差异进行对比与分析。结果显示：Artverviricota、Uroviricota是3种啮齿动物共有的优势病毒门，Betaretrovirus、Gammaretrovirus是3种啮齿动物共有的优势病毒属。此外，3种啮齿动物肠道病毒群落之间存在显著差异，有9个门18个属的病毒在不同样本中得到富集。在肠道相对丰度前10的病毒中，大林姬鼠与黑线姬鼠之间有5个门5个属具有显著差异，棕背■与大林姬鼠之间有3个门和6个属具有显著差异。在门水平上棕背■与大林姬鼠肠道病毒组成相似度更高，而属水平上则是黑线姬鼠与大林姬鼠肠道病毒组成更高。在门水平上生境对肠道病毒组成的影响较大，在属水平上则是亲缘关系对肠道病毒组成的影响较大。

关键词

啮齿动物 / 肠道病毒 / 宏基因组 / 东北地区