鳜KLF6序列特征、组织表达及其对BCAAs代谢酶基因表达的影响

doi:10.16088/j.issn.1001-6600.2024022602

广西师范大学学报（自然科学版） ›› 2024, Vol. 42 ›› Issue (06) : 236 -243. DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2024022602

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摘要

为研究鳜KLF6基因序列特征、组织表达及其对支链氨基酸代谢酶基因表达的影响，通过在线工具和软件对KLF6基因进行生物信息学分析，运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术，检测KLF6基因在鳜7个不同组织的表达丰度及用siRNA干扰后KLF6基因和BCAAs代谢相关酶基因的mRNA表达量。结果表明：鳜KLF6基因编码区全长为3 791 bp (登录号：XM＿044176560.1),其中5′端和3′端分别为271和2 659 bp,开放阅读框860 bp,共编码氨基酸286个。与鳃棘鲈KLF6基因的亲缘关系最近(98.6%),与鲤鱼较远(82.3%)。KLF6有1个KLF6-N型结构域(2-204 aa)、1个COG5048结构域(194-268 aa)和3个Znf-C2H2结构域(分别位于203-227、233-257、263-285个氨基酸之间)。鳜KLF6蛋白二级结构由无规则卷曲(56.99%)、α-螺旋(26.22%)、延伸链(10.84%)和β-转角(5.94%)相互连接而成。RT-qPCR结果发现，KLF6基因在鳜组织的相对表达量大小由高到低依次为心脏、脾脏、脑、肾脏、肠道、肌肉、肝脏。其中，心脏的表达量显著高于肝脏(P<0.01)和肌肉(P<0.05),脾脏、脑、肾脏及肠道的表达量高于肝脏(P<0.05)。在KLF6基因的mRNA表达量受到抑制后，BCAAs代谢酶(BCKDHb、ACADM、MCCC1、MCCC2、MUT、IVD)基因的mRNA表达量显著上升(P<0.05)。本研究为KLF6基因在鳜肌肉BCAAs代谢的调控机制研究提供了依据。