DNA修复相关基因与基底细胞癌的孟德尔随机化研究

摘要

目的 利用孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)分析结合全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)数据，探讨DNA修复相关基因，特别是其顺式表达的数量性状位点(expression quantitative trait Loci, eQTL)与基底细胞癌(basal cell carcinoma, BCC)之间的因果关系。方法 使用公开发布的GWAS汇总数据进行孟德尔随机化分析，以逆方差加权分析法作为主要分析方法，加权中位数、MR-Egger回归法对结果进行加强分析，评估DNA修复相关基因与基底细胞癌的关系，并对结果的异质性和水平多效性进行敏感性分析。结果 本研究确定了4个DNA修复基因，其中MDC1(OR=1.22,95%CI:1.12～1.33,P=0.00)和RAD52(OR=1.10,95%CI:1.02～1.19,P=0.02)会增加基底细胞癌的患病风险，而PALB2(OR=0.63,95%CI:0.41～0.96,P=0.03)和RAD51B(OR=0.78,95%CI:0.61～0.99,P=0.04)会降低基底细胞癌的患病风险。敏感性分析证实了这些结果的稳健性，没有发现异质性或一因多效的问题。Steiger Test方向性检验表明，从DNA修复基因到基底细胞癌具有明确的因果方向，而共定位分析显示MDC1具有显著的共享因果变体。外部验证证实了这些发现，表明MDC1在基底细胞癌患者和对照之间存在显著的表达差异(P<0.05)。结论 关键的DNA修复基因中，MDC1和RAD52可增加基底细胞癌的患病风险，而PALB2和RAD51B可降低基底细胞癌的患病风险，这可能是早期诊断和治疗靶点的潜在生物标志物。

关键词

DNA修复相关基因 / 基底细胞癌 / 孟德尔随机化