干旱胁迫下冬小麦叶面积指数的高光谱监测

陈艳霞 ,  闫晓斌 ,  王超 ,  冯美臣 ,  肖璐洁 ,  杨武德

山西农业科学 ›› 2024, Vol. 52 ›› Issue (06) : 136 -144.

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山西农业科学 ›› 2024, Vol. 52 ›› Issue (06) : 136 -144. DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2024.06.17
农业信息技术·农产品加工

干旱胁迫下冬小麦叶面积指数的高光谱监测

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Hyperspectral Monitoring of LAI in Winter Wheat under Drought Stress

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摘要

为实现干旱条件下冬小麦叶面积指数(LAI)的快速精准监测,为我国干旱半干旱地区的冬小麦安全生产提供理论和技术支持,为干旱条件下冬小麦LAI的快速精准监测提供参考,以不同干旱条件下的冬小麦为研究对象,测定关键生育时期冬小麦的LAI和冠层高光谱反射率,探索冬小麦LAI和高光谱反射率间的响应趋势,分别采用一阶微分(1ST)、标准正态变换(SNV)和对数变换(Log)3种方法对原始光谱反射率(R)进行预处理;对比分析不同预处理后光谱反射率与LAI的相关关系,采用偏最小二乘回归(PLSR)算法构建不同预处理下冬小麦LAI的监测模型。结果表明,在可见光区域和1 100~1 800 nm光谱区域,随着LAI的升高,光谱反射率呈现出逐渐增大的趋势;3种预处理方法均改善了光谱反射率与冬小麦LAI的相关性,其中1ST预处理后的光谱反射率与LAI的相关性最高,在1 209 nm处相关系数达到了0.550。基于1ST预处理后光谱反射率,采用PLSR构建的冬小麦LAI监测模型表现最佳,相较R-PLSR模型,1ST-PLSR校正模型和验证模型的决定系数分别提高了42.974%和8.842%,均方根误差分别降低了33.710%和8.111%,相对分析误差分别提高了50.838%和8.813%。

Abstract

To enable the rapid and accurate monitoring of leaf area index(LAI) in winter wheat under drought conditions, for providing theoretical and technical support for the safe production of winter wheat in arid and semi-arid regions of China and providing reference for rapid and accurate monitoring of winter wheat LAI under drought conditions. In this study, taking winter wheat under different drought conditions as the research object, the LAI and canopy hyperspectral reflectance of winter wheat in key reproductive period was measured the response trend between LAI and hyperspectral reflectance was explored, and the raw spectral reflectance(R) was pre-processed using three methods includingfirst-order differentiation(1ST), standard normal variation(SNV), and logarithmic transformation(Log). The correlation between spectral reflectance and LAI after different preprocesses was comparatively analyzed, and the partial least squares regression(PLSR) algorithm was employed to construct models for monitoring LAI in winter wheat under different pretreatments. The results indicated that spectral reflectance exhibited a gradual increase in tandem with rising LAI in the visible region and the 1100–1800 nm spectral region. All three preprocessing methods improved the correlation between spectral reflectance and LAI of winter wheat, with the highest correlation following 1ST pretreatment, which reached 0.550 at 1209 nm. The LAI monitoring model for winter wheat constructed using PLSR based on 1ST preprocessed spectral reflectance performed the best. Compared to the R-PLSR model, the r2 of the 1ST-PLSR correction model and validation model increased by 42.974% and 8.842%, while the root mean square error decreased by 33.710% and 8.111%, and the ratio of performance to deviation increased by 50.838% and 8.813%.

Graphical abstract

关键词

冬小麦 / 叶面积指数 / 光谱 / 偏最小二乘回归 / 预处理方法

Key words

winter wheat / leaf area index / spectrum / partial least squares regression / preprocessing methods

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陈艳霞,闫晓斌,王超,冯美臣,肖璐洁,杨武德. 干旱胁迫下冬小麦叶面积指数的高光谱监测[J]. 山西农业科学, 2024, 52(06): 136-144 DOI:10.3969/j.issn.1002-2481.2024.06.17

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随着全球气候变化加剧,极端气候灾害出现的频率逐渐增加,其中干旱是影响作物安全生产的主要农业气象灾害[1-2]。作为三大主粮之一,小麦的稳产和高产直接关系到国家粮食安全和社会稳定[3]。我国冬小麦生产主要分布在干旱、半干旱地区,水资源匮乏及干旱气候的加剧严重制约了小麦的生产[4]。实现干旱地区冬小麦长势状况的快速无损监测是保障冬小麦安全生产的重要前提。叶面积指数(LAI)是单位土地面积上绿叶总面积与土地面积之比或单位面积上植物叶片垂直于地面投影面积总和,与植被的光合作用、呼吸作用、水分调控和碳氮循环有密切关系[5]。实现干旱条件下冬小麦LAI的快速无损监测,对我国干旱地区冬小麦长势的快速精准监测有重要参考价值。
传统破坏性取样测定冬小麦LAI的方法不仅效率较低,而且测定样本的选取也具有主观性,对农田管理的指导具有滞后性。近年来,高光谱遥感凭借其波段数量多、分辨率高以及波谱特征敏感等优势在作物光谱特征变化和生长生理指标监测以及估产方面发挥重要作用,光谱技术的发展为作物长势参数的快速无损监测提供了新思路[6-8]。苏钰格等[9]筛选出与LAI相关系数高的光谱特征波段和植被指数,构建了多因子LAI估算模型。李靖言等[10]优选出与春小麦抽穗期LAI相关性较强的6种植被指数,通过多变量机器学习方法构建了春小麦LAI反演模型。然而,光谱指数法包含的光谱信息较少,构建的LAI监测模型的精度一般较低。相较于光谱指数法,多元统计分析方法以全波段光谱信息为自变量构建定量监测模型,波谱信息全面,模型鲁棒性强,准确度高[11]。武改红等[12]以连续2 a的氮素运筹试验为基础,通过测定各生育时期的冠层光谱和LAI,利用多元统计分析方法构建了LAI估测模型。王超等[13]采用主成分分析的方法构建了冬小麦综合长势指标,并构建了基于全谱的冬小麦长势指标估算模型。然而,在全光谱的信息中包含了大量的冗余信息,如何去除或减小冗余信息的干扰是提升模型精度的关键[14]
大量研究采用线性回归的方法来构建关于作物理化参数的光谱监测模型[15-17]。然而,在光谱波段的数量超过样本数量的情况下,这种方法往往存在过拟合问题。偏最小二乘回归结合了主成分分析、多元线性回归和典型相关分析3种方法的优点,可以将大量的共线光谱数据压缩成几个不相关的主成分,克服了光谱数据的共线性和过拟合问题[18]。闫晓斌等[19]采用偏最小二乘(PLS)构建了干旱胁迫下冬小麦光合色素的监测模型,其中叶绿素b含量和类胡萝卜素含量的监测模型决定系数分别达到了0.696和0.493。LI等[20]比较了光谱指数和偏最小二乘回归(PLSR)在冬小麦冠层氮含量监测方面的性能,结果表明,与表现最好的光谱指数相比,PLSR模型校正和验证模型的决定系数分别提高了76.8%和75.5%。然而,在冠层水平获取的作物光谱信息通常会受到如土壤背景、大气水分等环境噪声的影响,对光谱数据进行预处理是消除环境噪声的有效方法[21]。乔星星等[22]采用移动窗口最小二乘多项式平滑方法对原始光谱反射率进行了预处理,结果表明,9点平滑处理提高了光谱与冬小麦地上干生物量的相关性。张月等[23]采用5种方法对冬小麦光谱反射率进行了预处理,结果表明,与原始光谱相比,预处理光谱可以显著提高光谱反射率与冬小麦植株含水量的相关性。
本研究采用多种方法对冬小麦冠层光谱反射率进行预处理,结合偏最小二乘回归(PLSR)构建了冬小麦LAI监测模型,旨在明确LAI的高光谱响应趋势,为冬小麦LAI的高效精准监测提供理论依据和技术支持。

1 材料和方法

1.1 试验地概况

试验于2020年10月至2021年7月在山西省晋中市太谷区山西农业大学农学院农作站进行(37°25′19.81″N,112°34′16.96″E)。试验地土壤为石灰性褐土。土壤有机质含量22.01 g/kg,碱解氮53.8 mg/kg,有效磷18.43 mg/kg,速效钾236.9 mg/kg;田间最大持水量为24%。试验地建有钢化防雨棚,可消除自然降雨的影响。小区面积为4.5 m2(3.0 m×1.5 m),共48个小区。

1.2 试验材料

供试小麦品种为长4738(水地品种)和长6878(旱地品种)。

1.3 试验设计

试验采用完全随机设计,种植行距为20 cm,播种前灌足底墒水,播种后统一浇灌越冬水和返青水。试验处理为:拔节期—抽穗期进行干旱胁迫,其他生育时期保持充分灌溉,胁迫程度分为不胁迫、轻度、中度和重度胁迫,每个处理3次重复;开花期—灌浆期进行干旱胁迫,其他生育时期保持充分灌溉,胁迫程度分为不胁迫、轻度、中度和重度胁迫,每个处理3次重复。根据田间持水量的百分比控制水分,其中,不胁迫为土壤质量含水量占田间持水量的75%~80%,轻度胁迫为土壤质量含水量占田间持水量的65%±5%,中度胁迫为土壤质量含水量占田间持水量的55%±5%、重度胁迫为土壤质量含水量占田间持水量的45%±5%。期间每隔3 d采用烘干法测定一次土壤含水量,并进行土壤水分的控制,使土壤含水量保持在目标含水量附近。

1.4 数据采集

在晴朗无云、风力小于3级的天气,于10:00—12:00采用美国ASD公司生产的ASD FieldSpec 3.0光谱仪采集冬小麦冠层光谱反射率。采集时将探头置于小麦冠层上方80 cm,选择每个小区长势均匀的3个位置测定光谱反射率,取平均值作为该小区的光谱反射率。测定过程中每10 min进行一次白板校正。同时,在采集光谱反射率的位置,采用作物冠层分析仪Sunscan测定冬小麦的LAI。测定时,由仪器内的传感器对冠层顶部及底部的辐射值进行测量,然后自行计算出冬小麦冠层的透过率。在测定前,调整Sunscan参数,设置山西省晋中市太谷区的经纬度为112.6°E,37.4°N。椭球体叶倾角分布参数(ELADP)为1,叶片消光系数为0.85。

1.5 光谱数据预处理

在1 400 nm和1 900 nm波段附近,电磁波主要被水分子吸收,原始光谱反射率在这2个波长区域附近形成了波动的毛刺[24],故本研究剔除了这2个波长区域附近的光谱反射率。为了提高数据的灵敏度和信噪比,本研究对原始光谱数据(R)进行了一阶微分(1ST)、标准正态变换(SNV)和对数变换(Log)3种预处理。其中,1ST预处理可以有效消除由背景漂移造成的干扰,降低误差,从而提高数据的分辨率和灵敏度;SNV预处理通过对每个样本的光谱数据进行标准化,进而消除光谱数据中的散射效应和基线漂移等干扰因素;Log预处理可以突出光谱数据中的某些特征,使其更加明显和易于识别。

1.6 数据分析与模型评价

采用ViewSpecPro软件进行光谱数据异常值的剔除,采用The Unscrambler X 10.4对光谱数据进行一阶微分(1ST)、标准正态变换(SNV)和对数变换(Log)预处理。采用Matlab 2019进行相关性分析,应用Matlab中Plsregress函数进行数据的偏最小二乘回归分析。Plsregress是Matlab中用于执行偏最小二乘回归分析的函数,结合了主成分分析和多元线性回归的特点,旨在降低预测模型中的自变量之间的共线性,并通过捕捉自变量和因变量之间的主要关系来建立模型。在使用Plsregress函数进行偏最小二乘回归分析后,通过回归系数矩阵(BETA)计算新数据的预测值。采用Excel对数据进行描述性统计,其中极差是数据集中最大值与最小值之间的差,它反映了数据波动的范围。偏度是衡量数据分布偏斜程度的统计量。当数据分布对称时,偏度为0;如果偏度大于0,表示数据分布向右偏斜;如果偏度小于0,表示数据分布向左偏斜。峰度是衡量数据分布尖锐程度的统计量,当数据分布是正态分布时,峰度为0;如果峰度大0,表示数据分布的形态比正态分布更尖锐;如果峰度小于0,表示数据分布的形态比正态分布更扁平。峰度的绝对值越大,表示数据的分布形态与正态分布的形态差异越大。采用Origin 2021进行绘图。本研究采用决定系数(r2)、均方根误差(RMSE)和相对分析误差(RPD)对模型的精度进行评价,用r2c和RMSEc表示校正集的r2和RMSE,用r2v和RMSEv表示验证集的r2和RMSE,其中r2越高且越接近1、RMSE越小表示模型的拟合效果和预测能力越好。RPD值越高,表示模型的预测能力越好。一般情况下,当RPD<1.4时,表明模型的预测能力较差;当1.4≤RPD<2.0时,表明模型的预测能力较好,当RPD≥2.0时,表明模型的预测能力很好[25]

r2=i=1n(Yi'-Y¯i)2i=1n(Yi-Y¯i)2
RMSE=1ni=1n(Yi-Yi')2
RPD=SDRMSE×nn-1

式中,n为样本个数,Yi'Yi分别为样本的预测值和实测值,Y¯i是样本实测值的平均值,SD为样本标准差。

2 结果与分析

2.1 冬小麦LAI分析

本研究采集了冬小麦拔节期、孕穗期、抽穗期和灌浆期4个关键生育时期的冠层光谱反射率和LAI,每个生育时期均采集48个样本,共192个样本。采用梯度划分的方式,按照冬小麦的LAI数值大小排列的顺序,将样本按3∶1划分为校正集和验证集。从表1可以看出,所测定LAI的数值范围在2.267~10.767,校正集、验证集和总样本的LAI平均值分别为6.174、6.200和6.181。3个数据集LAI的标准差在1.707~1.712,偏度和峰度均在0附近,表明数据基本符合正态分布,可进一步进行统计分析。

图1可知,冬小麦在生长发育过程中,LAI呈现出先升高后降低的趋势。拔节期的冬小麦LAI分布于2.3~6.0,在抽穗期达到了最大值,之后逐渐下降。可以看出,在不同干旱胁迫下,冬小麦LAI有较大的变化。拔节期—灌浆期LAI的标准差分别为0.988、0.946、1.320、0.925;变异系数分别为24.9%、13.7%、17.6%、14.6%。

2.2 冬小麦冠层高光谱反射率变化趋势分析

为明确冬小麦LAI的高光谱响应趋势,本研究分析了4个梯度下LAI的光谱曲线变化规律和不同生育时期冬小麦光谱曲线的变化趋势。从图2-A可以看出,在可见光区域和1 100~1 800 nm光谱区域,随着LAI从2~4范围逐渐升高到8~10范围,光谱曲线也逐渐升高,光谱反射率呈现出逐渐增大的趋势。图2-B展示了随着生育时期的推进光谱反射率的变化趋势,从拔节期到灌浆期,在可见光谱区域和1 450~1 800 nm光谱区域,光谱曲线呈现出逐渐增高,冬小麦光谱反射率呈现出逐渐升高的现象。从随着LAI范围逐渐增大以及生育时期的推进,冬小麦光谱反射率的变化趋势可以看出,不同生育时期冬小麦光谱反射率变化明显,冬小麦LAI与光谱反射率有敏感的响应关系。此外,本研究采用3种方法对原始光谱反射率进行了预处理,结果如图2-C—F所示,以LAI=6.1时所对应的光谱曲线为例,采用SNV和Log预处理后,光谱曲线的变化较小;1ST预处理后,光谱曲线产生了较大的变化,波峰和波谷的位置明显突出。

2.3 冬小麦LAI与冠层光谱反射率的相关性分析

本研究选取了3种方法对冬小麦4个生育时期LAI的原始光谱数据进行了预处理。由图3可知,原始光谱反射率与LAI呈现出正相关关系,其绝对相关系数最大为0.454。经过1ST、SNV和Log预处理后的光谱反射率与LAI的相关关系较原始光谱反射率有了明显的增强。由于1ST预处理突出了光谱中的峰值和变化点,因此,1ST预处理后的光谱反射率与LAI的相关系数在全波谱上产生了较大的变化,在1 209 nm处相关系数达到了0.550;SNV预处理后的光谱反射率与LAI的相关性整体得到了提升,在1 529 nm处相关系数达到了0.538,然而,光谱反射率在近红外平台与LAI的相关性呈现出负相关关系;Log预处理后,在一定程度上提升了LAI与光谱反射率的相关性,在400 nm处,相关系数达到了0.524。

2.4 冬小麦LAI的高光谱监测模型

本研究在对原始光谱反射率进行预处理后,采用PLSR分别构建了基于原始光谱反射率和3种预处理后光谱反射率的LAI监测模型。由表2可知,基于3种预处理后光谱反射率构建的冬小麦LAI监测模型表现均优于基于原始光谱反射率构建的冬小麦LAI监测模型,其中,SNV-PLSR模型校正集和验证集的r2分别提高了18.464%和7.235%,Log-PLSR模型校正集和验证集的r2分别提高了24.510%和7.235%。基于1ST预处理后构建的PLSR模型表现最佳,校正集和验证集的r2分别提高了42.974%和8.842%,RMSE分别降低了33.710%和8.111%,RPD分别提高了50.838%和8.813%。

图4为4个LAI监测模型的拟合图,从拟合效果来看,4个模型的实测值普遍低于预测值,基于1ST构建的LAI监测模型表现最好,拟合线在1∶1拟合线附近。

3 结论与讨论

LAI是评估作物长势的重要指标,实现LAI的快速精准监测对农田管理及时作出决策具有重要意义[26]。光谱遥感技术是实现冬小麦LAI高通量监测的有效工具[27]。光谱数据的获取通常会受到环境因素的干扰,在测定冬小麦冠层光谱反射率时,光谱反射率包含了小麦冠层结构以及土壤背景等信息,消除光谱噪声是提高模型精度的关键[28-29]。有研究表明,光谱预处理能有效减小或消除环境因素对光谱反射率的干扰[30]。经过3种预处理后,从光谱反射率的数值与冬小麦LAI的相关性来看,本研究所采用的3种预处理方法均不同程度增强了处理后的光谱数据与LAI的相关性,其中1ST的增强效果最佳。从原始光谱反射率与LAI的相关性来看,在全光谱波段范围内,光谱反射率与LAI呈现出正相关关系,相关系数最高,为0.454。有研究表明,微分处理技术在降低低频背景光谱对目标光谱影响和凸显光谱特征方面具有重要的作用[31]。经过1ST预处理后,光谱反射率与LAI在全光谱波段范围内的相关性发生了较大的变化,光谱特征得到了增强,在1 209 nm处相关系数达到了0.550,较原始光谱反射率与LAI的相关系数增强了21.145%。刘伟东等[32]研究同样表明,微分处理能够改善光谱数据与LAI的相关性。

偏最小二乘回归是高光谱监测作物长势中最常用的建模方法,其优势在于克服了光谱数据间的多重共线性问题[33-34]。本研究采用PLSR构建了不同预处理下的LAI监测模型,从模型表现来看,基于1ST预处理后光谱反射率构建的冬小麦LAI监测模型表现最好,校正集和验证集的r2分别提高了42.974%和8.842%。相较校正模型的r2,1ST-PLSR模型验证模型的r2较低,用于训练的数据表现良好,用于验证的数据泛化能力较差。由此可见,构建的1ST-PLSR模型在一定程度上存在过拟合现象,可能是由于研究样本数量相对较少,在接下来的研究中,应当丰富样本的数量,同时需要对增加的样本进行筛选,较大程度提升模型的精度[35]。此外,随着计算机技术的发展,机器学习和深度学习成为当下研究的热点,在本研究的基础上,未来应该探索不同算法结合光谱预处理方法监测冬小麦LAI的能力,为冬小麦LAI的高通量精准监测作出贡献[36-37]

本研究获取了不同干旱条件下冬小麦LAI数据和高光谱数据,分析了LAI的高光谱特征,对比了不同光谱预处理方法对模型精度提升的贡献。结果表明,3种预处理方法均不同程度增强了光谱反射率与LAI的相关性,其中1ST预处理后的光谱反射率与LAI的相关性最强,在1 209 nm处相关系数达到了0.550。对比基于原始光谱反射率和3种预处理后光谱反射率构建的LAI监测模型可以发现,冬小麦LAI的最优模型为1ST-PLSR(r2v=0.677,RMSEv=0.963,RPD=1.778)。本研究结果为冬小麦LAI的快速精准监测提供了理论依据和技术支持。

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基金资助

山西省应用基础研究计划(202203021211275)

山西省应用基础研究计划(202203021212188)

山西省应用基础研究计划(202303021212090)

山西省研究生科研创新项目(2023KY331)

国家自然科学基金(31871571)

国家自然科学基金(31371572)

山西省现代农业产业技术体系建设专项(2023CYJSTX02-23)

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