黄芪多糖对鸡巨噬细胞免疫应答的转录-代谢组学研究

摘要

【目的】利用转录组学和代谢组学联合分析200μg/mL黄芪多糖（APS）对鸡巨噬细胞HD11免疫作用，探讨200μg/mLAPS对鸡巨噬细胞HD11免疫应答的作用机制。【方法】设置空白对照组（CON组）和200μg/mLAPS处理组(A₂₀₀组)，其中A₂₀₀组和CON组分别用含200μg/mLAPS的完全培养液培养和完全培养液培养HD11细胞12 h。通过转录组和代谢组分析筛选差异表达基因和差异代谢物，之后联合KEGG富集分析，构建相关网络互作图并进行转录组与代谢组联合分析。【结果】转录组结果表明，在A₂₀₀组与CON组中共检测到差异基因1 196个，其中上调基因862个，下调基因334个；KEGG分析表明，差异表达基因主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、ECM受体相互作用、吞噬体等多种途径；代谢组结果表明，在A₂₀₀组与CON组中共筛选出差异代谢物138个，其中下调差异代谢物84个，上调的差异代谢物54个。KEGG通路分析表明，差异物主要富集到氨基酸代谢、类脂物代谢、辅助因子和维生素的代谢、核苷酸代谢以及信号传导等多个途径；转录组与代谢组联合分析表明，差异基因与差异代谢物显著富集于组氨酸代谢、嘌呤代谢、碳代谢、二羧酸代谢、谷胱甘肽代谢、神经活性配体-受体相互作用、β-丙氨酸代谢、嘧啶代谢、磷脂酰肌醇信号系统等。【结论】200μg/mLAPS处理HD11细胞可能是通过糖酵解和磷酸戊糖途径以及Toll样受体信号通路对HD11细胞发挥免疫增强作用。

关键词

黄芪多糖 / 巨噬细胞 / 转录 / 代谢