利用微卫星及线粒体分子遗传标记的西藏吉拉牦牛群体遗传多样性研究

摘要

【目的】旨在探究西藏吉拉牦牛遗传多样性水平及对群体遗传结构进行评估与鉴定。【方法】利用12个微卫星分子标记和mtDNAD＿Loop序列对全部111个吉拉牦牛开展基因分型和遗传评估。【结果】微卫星标记结果显示在12个位点中共检测出76个等位基因，其中TGLA53携带最多复等位基因数（10）。除AGLA293位点表现为低多态性（PIC<0.25）外，其他11个位点均表现为高多态性位点（PIC>0.5）。隆格尔乡的吉拉牦牛群体平均观测杂合度为（0.615 3±0.022 3）、等位基因型数量为（5.58±1.31），吉拉乡群体的平均观测杂合度为（0.588 4±0.016 9）、等位基因型数量为（5.67±1.44），另外近交系数（FIS）分析显示吉拉牦牛可能存在显著近交风险（FIS=0.098,P<0.000 4）。瓶颈效应分析结果显示，在SMM和TPM模型下吉拉牦牛未显著经历瓶颈效应。群体遗传分歧结果显示吉拉乡和隆格尔乡两地吉拉牦牛群体间遗传分歧不显著。通过mtDNAD＿Loop序列研究结果显示在665 bp的D＿Loop序列范围内共鉴定到53个多态位点（占总序列的7.97%），构建获得32个单倍型。吉拉牦牛群体平均单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（Pi）分别为0.910 57和0.013 05，表明吉拉牦牛母系遗传多样性丰富。【结论】吉拉牦牛群体内虽具有较丰富的遗传多样性水平，但群体整体仍存在近交风险。

关键词

吉拉牦牛 / 微卫星遗传标记 / 线粒体DNA / 遗传多样性