基于GWAS挖掘甘蓝型油菜茎秆饲用品质候选基因

摘要

【目的】油菜不仅是重要的油料作物，其叶和茎还可用作动物饲料，茎秆中木质纤维素含量与饲用品质和适口性密切相关。但是目前油菜中普遍存在薹茎粗纤维含量高等缺点，降低了饲料的适口性、消化率及营养价值，。因此对薹茎粗纤维进行遗传分析具有重要意义。【方法】对494份甘蓝型油菜品种采用Van Soest方法测定酸性洗涤纤维（ADF）和中性洗涤纤维（NDF）含量，采用Illumina 60 K SNP芯片对供试材料材料进行基因分型，用MLM和GLM 2种模型进行全基因组关联分析（GWAS）。【结果】59个SNP和45个SSR位点分别与ADF和NDF含量呈显著相关，这2种标记共检测到9个与ADF和NDF含量相关联的位点。其中，在A05染色体上有3个与ADF含量相关的候选基因（1个CTL2、2个TBL41s）,A03和C03染色体上有4个与NDF含量相关的候选基因，分别是GH、RGP1、UGT74F2和CESA5，这些候选基因参与次生细胞壁形成和木质纤维素生物合成途径。【结论】研究结果为深入挖掘油菜饲用品质性状相关基因，提高油菜饲用效率提供理论依据。

关键词

甘蓝型油菜 / GWAS分析 / ADF / NDF / 茎杆 / 饲用价值