阻遏引物在入侵虎龙杂交斑食物组成分析的有效性

杨清艳; 胡书杰; 李建龙; 章翔

doi:10.15886/j.cnki.hndk.2025031201

海南大学学报（自然科学版中英文） ›› 2025, Vol. 43 ›› Issue (05) : 521 -529. DOI: 10.15886/j.cnki.hndk.2025031201

阻遏引物在入侵虎龙杂交斑食物组成分析的有效性

杨清艳, 胡书杰, 李建龙, 章翔

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摘要

为了解决使用DNA宏条形码技术对具有高空胃率的入侵虎龙杂交斑胃含物残余DNA扩增过程中面临的捕食者DNA高度污染问题，设计了3条退火阻遏引物并进行测试，随后将阻遏引物应用于入侵虎龙杂交斑胃含物残余DNA分析。结果表明：具有最高解链温度（melting temperature,T_m）的阻遏引物EFELblock2在退火温度56℃且浓度为10μmol·L^-1时即具有最好阻断效果；添加阻遏引物不会对虎龙杂交斑潜在被捕食物种残余DNA宏条形码序列扩增造成抑制。高通量测序分析显示，添加阻遏引物后虎龙杂交斑自身序列占比显著降低且对其被捕食者多样性信息重构未产生影响。研究结果可为虎龙杂交斑风险评估提供数据支撑，也为进一步评估其对海洋生态系统的负面影响奠定重要基础。