南极利奇菲尔德岛土壤微生物多样性的初步分析

宋易洋, 李桂秀, 赵芯, 王国良

烟台大学学报(自然科学与工程版) ›› 2020, Vol. 33 ›› Issue (3) : 276 -282.

烟台大学学报(自然科学与工程版) ›› 2020, Vol. 33 ›› Issue (3) : 276 -282. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.191105

南极利奇菲尔德岛土壤微生物多样性的初步分析

    宋易洋, 李桂秀, 赵芯, 王国良
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摘要

为探索南极土壤微生物的多样性,本研究以对中国第31次南极科学考察采集的利奇菲尔德岛的不同地理位置的3份土壤样本作为研究对象,基于Illumina NovaSeq测序平台对其进行宏基因组高通量测序,经生物信息学分析,结合MetaPhlAn2、GraPhlAn等分析方法将测序数据精确定位至微生物中属或种的水平,鉴定共获得来自8门11纲20目27科35属38种的微生物序列.样本间微生物丰度差异较大,其中S14样本的优势菌属是颗粒菌属(Granulicella); S16样本的优势菌属是罗思河小杆菌属(Rhodanobacter); S22样本的优势菌种是白色念珠菌(Candida albicans).研究结果对南极土壤微生物资源的利用、开发与保护具有重要意义.

关键词

南极 / 土壤微生物 / 宏基因组测序 / 生物多样性

Key words

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宋易洋, 李桂秀, 赵芯, 王国良. 南极利奇菲尔德岛土壤微生物多样性的初步分析[J]. 烟台大学学报(自然科学与工程版), 2020, 33(3): 276-282 DOI:10.13951/j.cnki.37-1213/n.191105

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