高原鳅属鱼类线粒体全基因组序列结构特征及其系统发育信息

李瑶瑶; 刘云国; 刘凌霄; 韩庆典; 马超; 全先庆; 张海光; 张如华

doi:10.13951/j.cnki.37-1213/n.200202

烟台大学学报（自然科学与工程版） ›› 2021, Vol. 34 ›› Issue (1) : 93 -99. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.200202

高原鳅属鱼类线粒体全基因组序列结构特征及其系统发育信息

李瑶瑶, 刘云国, 刘凌霄, 韩庆典, 马超, 全先庆, 张海光, 张如华

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摘要

为了深入开展高原鳅属(Triplophysa)鱼类的分类鉴定、系统进化等研究,利用生物信息学的方法分析了37种高原鳅属鱼类的线粒体全基因组序列及系统发育信息。通过Clustal X对线粒体DNA(mt DNA)全基因组序列进行对比,然后用MEGA7分析mt DNA的序列差异,并用邻接法生成系统进化树。结果发现:(1)高原鳅属鱼类线粒体基因组的全长在16 562～16 681 bp之间,其基因组结构和基因排列顺序与其他硬骨鱼类的线粒体基因组特征相同;(2)在所有编码基因中,ND2基因的序列变异程度最大(52.5%),且Kimura双参数(K2P)遗传距离最大(0.232),而16S rRNA的变异程度最小(19.9%),12S rRNA基因的K2P遗传距离最小(0.034);(3)系统进化树显示高原鳅属中除叶尔羌高原鳅(Triplophysa yarkandensis)外,绝大多数物种能够聚为一支,未描述种(T.sp.)、玫瑰高原鳅(T.rosa)和湘西盲高原鳅(T.xiangxiensis)聚为一支并处于该属的基部位置。