水杨酸类酪氨酸蛋白磷酸酯酶1B抑制剂的分子对接和三维定量构效关系研究

黄文文; 毕毅; 陈蒙蒙; 夏国祥; 张振磊

doi:10.13951/j.cnki.37-1213/n.2014.02.012

烟台大学学报（自然科学与工程版） ›› 2014, Vol. 27 ›› Issue (2) : 117 -121. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.2014.02.012

水杨酸类酪氨酸蛋白磷酸酯酶1B抑制剂的分子对接和三维定量构效关系研究

黄文文, 毕毅, 陈蒙蒙, 夏国祥, 张振磊

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摘要

应用Surflex-dock对21个水杨酸类酪氨酸蛋白磷酸酯酶1B抑制剂进行分子对接分析,结果显示水杨酸结构的头部深入活性口袋内部,其氢键决定其与酶结合的稳定性,尾部结构及氢键决定其抑制活性.据此,利用Topomer CoMFA建模时将头尾结构切开分析,从21个化合物中随机选取17个化合物作为训练集,建立3D-QSAR模型,并用包括4个化合物的测试集验证模型的外部预测能力,结果显示模型具有良好的预测能力,预测活性与实测活性的差值均小于0.12μmol/L,该模型可以用于辅助设计同类型新化合物并进行其活性预测.