基于数字基因表达谱筛选双侧去势大鼠附睾的差异表达基因

李岩, 石慧, 赵振军

烟台大学学报(自然科学与工程版) ›› 2022, Vol. 35 ›› Issue (3) : 277 -284.

烟台大学学报(自然科学与工程版) ›› 2022, Vol. 35 ›› Issue (3) : 277 -284. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.210611

基于数字基因表达谱筛选双侧去势大鼠附睾的差异表达基因

    李岩, 石慧, 赵振军
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摘要

采用数字基因表达谱技术(DGE),探讨成年和双侧去势大鼠附睾基因表达谱的变化。在初步筛选的2 448个差异表达基因中,与对照组相比,双侧去势组大鼠附睾中分别有1 632/816个基因表达上调/下调。qPCR验证了随机挑选的6个差异表达基因,其表达趋势均与DGE结果相符。GO分析表明差异表达基因的功能分布相似,但上调组的突触部分和辅助转运蛋白是唯一的,而电子载体和病毒粒子部分仅出现在下调组。在差异表达的基因中,有1 881个基因被定位到KEGG数据库中的250条通路。通路富集分析表明,代谢通路、氧化磷酸化通路和溶酶体通路是三条显著富集的通路。本研究将为深入研究基因在附睾中的功能提供数据支持。

关键词

数字基因表达谱 / 大鼠 / 附睾 / 双侧去势

Key words

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李岩, 石慧, 赵振军. 基于数字基因表达谱筛选双侧去势大鼠附睾的差异表达基因[J]. 烟台大学学报(自然科学与工程版), 2022, 35(3): 277-284 DOI:10.13951/j.cnki.37-1213/n.210611

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