藜麦黄素单加氧酶基因(CqYUCCA)家族的全基因组鉴定与分析

褚晶; 田晓芹; 陈世华; 郭善利

doi:10.13951/j.cnki.37-1213/n.211114

烟台大学学报（自然科学与工程版） ›› 2023, Vol. 36 ›› Issue (1) : 20 -27. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.211114

藜麦黄素单加氧酶基因(CqYUCCA)家族的全基因组鉴定与分析

褚晶, 田晓芹, 陈世华, 郭善利

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摘要

利用生物信息学的方法从藜麦基因组中鉴定得到25个CqYUCCA基因，并对其蛋白信息、进化关系及表达模式进行了系统的分析。结果表明：25个CqYUCCA基因不均匀地分布在藜麦12条染色体上，基因家族亲缘关系显示其编码的蛋白被分成四个亚组，每组的基因结构及蛋白基序的位置、数量均具有较高的相似性。根据已发表转录组数据分析，部分CqYUCCA基因受到干旱、高温以及盐胁迫的诱导。这些结果为进一步研究CqYUCCAs蛋白的生物学功能奠定了基础。