藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析

田晓芹; 褚晶; 丁洪霞; 杨博; 陈方军; 郭善利; 陈世华

doi:10.13951/j.cnki.37-1213/n.211122

烟台大学学报（自然科学与工程版） ›› 2023, Vol. 36 ›› Issue (2) : 149 -156. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.211122

藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析

田晓芹, 褚晶, 丁洪霞, 杨博, 陈方军, 郭善利, 陈世华

作者信息 +

Author information +

文章历史 +

摘要

基于藜麦全基因组和转录组数据，利用生物信息学的方法对藜麦IPT(CqIPT)基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明，在藜麦基因组中鉴定到12个可分为4个亚组的CqIPT基因，同亚组CqIPT基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构；CqIPT基因家族所有成员的表达模式存在明显差异，CqIPT9仅在顶端分生组织和花序中显著表达，CqIPT5和CqIPT11在花和未成熟的种子及干种子中显著表达；非生物胁迫下的基因表达同样存在多种模式。本研究为深入研究藜麦CqIPT基因的功能提供了一定的理论基础。