藜麦RBOH基因家族的鉴定及表达模式分析

韩建玮, 杨冬冬, 曹萌, 张侠, 郭善利, 尹海波

烟台大学学报(自然科学与工程版) ›› 2023, Vol. 36 ›› Issue (4) : 410 -418.

烟台大学学报(自然科学与工程版) ›› 2023, Vol. 36 ›› Issue (4) : 410 -418. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.220627

藜麦RBOH基因家族的鉴定及表达模式分析

    韩建玮, 杨冬冬, 曹萌, 张侠, 郭善利, 尹海波
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摘要

为了探索藜麦RBOH基因(CqRBOH)的结构特征,分析CqRBOH基因功能和表达模式,基于藜麦全基因组数据,通过生物信息学的方法对CqRBOH基因进行鉴定分析。鉴定出9个CqRBOH基因家族成员,根据染色体上位置将其命名为:CqRBOH1—CqRBOH9;亚细胞定位预测结果表明,9个CqRBOH蛋白均定位于质膜上;基于系统进化树将CqRBOH基因家族分为4个亚家族,CqRBOH蛋白序列具有高度保守性,均含有NADPH氧化酶结构域(NADPH-Ox)等4个功能结构域;CqRBOH基因启动子区具有多种与非生物胁迫响应、激素响应以及与生长发育有关的顺式作用元件;转录组数据分析表明CqRBOH3和CqRBOH5在藜麦幼苗中显著表达,部分CqRBOH基因响应干旱、高温和盐胁迫,这些结果为藜麦抗逆机制研究奠定了基础。

关键词

藜麦 / 呼吸爆发氧化酶同源物 / RBOH基因家族

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韩建玮, 杨冬冬, 曹萌, 张侠, 郭善利, 尹海波. 藜麦RBOH基因家族的鉴定及表达模式分析[J]. 烟台大学学报(自然科学与工程版), 2023, 36(4): 410-418 DOI:10.13951/j.cnki.37-1213/n.220627

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