藜麦2,3-氧化角鲨烯环化酶基因(CqOSC)家族的全基因组鉴定与分析

摘要

基于藜麦全基因组和转录组数据，利用生物信息学的方法对藜麦CqOSC基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明，在藜麦基因组中鉴定到15个CqOSC基因家族成员，可分为3个亚组，同亚组CqOSC基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构；在藜麦正常生长发育过程中，CqOSC基因家族成员的表达模式存在明显差异，CqOSC7和CqOSC12在花和未成熟的种子及干种子中显著表达，而CqOSC9与CqOSC10在所有组织中均呈现出一定水平的表达；对于MeJA具有不同响应：CqOSC2、CqOSC4和CqOSC8基因表达量变化显著；CqOSC3、CqOSC6和CqOSC15基因表达量变化不明显；整体表现为“低促高抑”:在外施0.5 mmol/L和1 mmol/L MeJA时基因表达量显著上升，在浓度达到2 mmol/L时表达量显著下降。

关键词

藜麦 / 2,3-氧化角鲨烯环化酶 / CqOSC基因家族 / 生物信息学

基金资助

山东省“渤海粮仓”科技示范工程升级版计划项目(2019BHLC001); 烟台市校地融合发展项目