藜麦热激蛋白60(CqHSP60)基因家族生物信息学和表达模式分析

陈方军; 刘文莉; 杨博; 彭悦; 丁洪霞; 宫瑗; 尹海波; 郭善利

doi:10.13951/j.cnki.37-1213/n.221114

烟台大学学报（自然科学与工程版） ›› 2024, Vol. 37 ›› Issue (2) : 155 -162. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.221114

藜麦热激蛋白60(CqHSP60)基因家族生物信息学和表达模式分析

陈方军, 刘文莉, 杨博, 彭悦, 丁洪霞, 宫瑗, 尹海波, 郭善利

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摘要

为了探究藜麦HSP60基因(CqHSP60)的结构特征、基因功能和表达模式，基于藜麦全基因组和转录组数据，利用生物信息学方法对CqHSP60基因家族进行鉴定和系统分析。依据亚细胞结构定位分为了三个亚组，每个亚组具有相似的Motif和基因结构；通过RNA-Seq数据对CqHSP60基因在不同发育阶段进行了表达分析，并对在热、干旱、盐胁迫等不同处理条件下CqHSP60基因的胁迫响应进行了分析，结果表明CqHSP60基因在花簇和干种子中表达量较高，并对不同的胁迫模式均有响应；在CqHSP60基因的启动子区发现了多个与胁迫相关的顺式调控元件，这表明这些基因在多重胁迫下受到应激响应。

关键词

藜麦 / HSP60 / 表达模式 / 胁迫 / 伴侣蛋白

Key words

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陈方军, 刘文莉, 杨博, 彭悦, 丁洪霞, 宫瑗, 尹海波, 郭善利. 藜麦热激蛋白60(CqHSP60)基因家族生物信息学和表达模式分析[J]. 烟台大学学报（自然科学与工程版）, 2024, 37(2): 155-162 DOI:10.13951/j.cnki.37-1213/n.221114