小麦植物磺肽激素基因(TaPSK)家族生物信息学及表达模式分析

唐凯月, 赵晓彤, 陈磊, 张立培, 宋建成, 赵吉强

doi:10.13951/j.cnki.37-1213/n.230316

烟台大学学报（自然科学与工程版） ›› 2025, Vol. 38 ›› Issue (1) : 37 -46. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.230316

小麦植物磺肽激素基因(TaPSK)家族生物信息学及表达模式分析

唐凯月, 赵晓彤, 陈磊, 张立培, 宋建成, 赵吉强

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摘要

为探究TaPSK基因家族成员在根系发育中的作用，本研究利用生物信息学对其进行鉴定分析，通过转录组数据分析TaPSK基因在小麦不同组织的表达模式以及基因所在的染色体位置、基因结构、顺式作用元件等。结果表明：12个TaPSK中有11个属于TaPSK基因家族，TaPSK4属于PSK基因超家族，12个基因分布在A、B、D 3个基因亚族的9条染色体上；RNA-seq数据分析表明，11个TaPSK基因表达具有组织特异性，其中TaPSK3、TaPSK9～11基因在根系不同发育时期表达量均较高；从转录组数据中选取在根系中表达的10个TaPSK基因进行qRT-PCR验证，发现上述4个基因的确在苗期根中有着较高表达水平；顺式作用元件分析发现：TaPSK基因家族成员具有促进根系生长发育、应对胁迫响应及激素调控方面的响应元件。本研究结果可为后续深入研究TaPSK基因根系发育相关的生物学功能提供一定理论基础。