基于16S rDNA的高通量测序技术在口虾蛄食性分析中的可行性

丁家友; 董秀强; 王冉; 王蕾; 邱盛尧

doi:10.13951/j.cnki.37-1213/n.240409

烟台大学学报（自然科学与工程版） ›› 2025, Vol. 38 ›› Issue (4) : 419 -426. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.240409

基于16S rDNA的高通量测序技术在口虾蛄食性分析中的可行性

丁家友, 董秀强, 王冉, 王蕾, 邱盛尧

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摘要

在口虾蛄(Oratosquilla oratoria)摄食强度较高的10月，分别于邻近黄河口的东营近岸海域和远离黄河口的龙口近岸海域采集口虾蛄样本，通过基于16S rDNA的高通量测序技术鉴定其胃容物，分析了基于16S rDNA的高通量测序技术在口虾蛄食性分析中的可行性。测序结果共获得220个有效OTUs,可以对应注释到4门、6纲、20目、32科、45属。邻近黄河口海域口虾蛄饵料丰度相对百分比最高的是口虾蛄(91.08%),其次是软体动物(3.72%)、鱼类(3.71%)和虾类(1.39%)等，去除较高的口虾蛄序列丰度后，测序结果与胃容物观察法研究结果较一致。远离黄河口海域口虾蛄饵料丰度相对百分比最高的是虾类(41.75%),其次是鱼类(24.51%)、碎屑(16.12%)、口虾蛄(15.22%)等，测序结果与通过胃容物观察法研究结果较一致。基于16S rDNA的高通量测序技术在确定口虾蛄营养生态位方面表现出较好的潜力，但在确定口虾蛄食物摄入途径和猎物状态(卵、仔稚鱼、幼鱼、死亡个体)方面需要通过胃容物观察法进行补充。该测序技术在口虾蛄食性分析中的应用需要进一步设计完善扩增引物，测序结果需要进行合理的校准。