大西洋鲑环境和肠道内容物中微生物的差异

贾慧娟; 滕新栋; 邢志凯; 王丽君; 曲江勇; 王绪敏

doi:10.13951/j.cnki.37-1213/n.241102

烟台大学学报（自然科学与工程版） ›› 2026, Vol. 39 ›› Issue (2) : 187 -198. DOI: 10.13951/j.cnki.37-1213/n.241102

大西洋鲑环境和肠道内容物中微生物的差异

贾慧娟, 滕新栋, 邢志凯, 王丽君, 曲江勇, 王绪敏

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摘要

为了研究大西洋鲑养殖环境与肠道内容物中微生物群落组成与功能的差异，采用Illumina HiSeq X高通量测序仪对其养殖环境和肠道内容物中的微生物进行宏基因组测序。结果表明，肠道内容物中微生物的多样性低于循环水环境，这可能与宿主选择压力和特定环境条件有关。假单胞菌属和气单胞菌属等致病菌在循环水处理后占比下降。糖苷水解酶(GH)和糖基转移酶(GT)家族在环境和肠道中的分布差异反映了肠道微生物更侧重于糖类的合成和修饰，而环境微生物则侧重于糖类的降解。此外，肠道内容物中显著表达的emrB和vanH等抗生素抗性基因的表达与GT2和GT20等碳水化合物代谢酶的表达呈负相关，表明抗性基因的表达可能消耗能量和资源，影响微生物的代谢活动。这些发现为循环水养殖系统的优化提供了理论依据，有助于提高养殖效率和保障鱼类健康。