PARP1受体的结构模拟与作用方式研究

摘要

目的 通过多种分子模拟研究方法，探究PARP1受体的结构及其作用方式，为设计PARP1抑制剂提供理论指导。方法 基于PARP1受体的晶体结构，结合分子动力学模拟、动态互相关联矩阵及丙氨酸扫描等方法分析受体-配体作用方式，总结关键氨基酸信息，构建药效团模型，揭示PARP1抑制剂的构效关系。结果与结论 PARP1活性结构域的氨基酸高度保守，包括Gly202、Tyr228、Tyr235、Ser243和Tyr246,活性化合物的药效团特征包括一个芳香环、一个氢键受体、一个氢键供体和两个疏水基团，这些PARP1靶点的关键氨基酸和活性化合物的药效团特征可为发现新型PARP1抑制剂提供参考。

关键词

PARP1 / 分子动力学 / 丙氨酸扫描 / 动态互相关联矩阵 / 药效团模拟