新型CDK2变构小分子抑制剂的设计、合成、活性及代谢稳定性研究

洪悦, 宁少波, 钟杰, 张健, 赵明珠

中国药物化学杂志 ›› 2025, Vol. 35 ›› Issue (05) : 333 -346.

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中国药物化学杂志 ›› 2025, Vol. 35 ›› Issue (05) : 333 -346. DOI: 10.14142/j.cnki.cn21-1313/r.2025.05.001

新型CDK2变构小分子抑制剂的设计、合成、活性及代谢稳定性研究

    洪悦, 宁少波, 钟杰, 张健, 赵明珠
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摘要

目的 以CDK2变构抑制剂EF-3-006为先导化合物,通过骨架跃迁中的环闭合策略对其柔性连接体进行系统性改造,设计并合成一系列吲哚并五元环和双吲哚化合物,以期获得代谢稳定性强的CDK2变构小分子抑制剂。方法 以苯肼盐酸盐类化合物为起始原料,经Fischer吲哚合成、脱保护、亲核取代、酯水解反应得到化合物C01~C14;以吲哚-2-甲酸类化合物为起始原料,经还原、偶联、羰基化反应得到化合物C15~C17。采用ADP-Glo激酶检测体系,测定目标化合物对CDK2激酶活性的抑制作用,利用人肝微粒体代谢实验评估化合物的代谢稳定性。进一步通过表面等离子体共振技术与定点突变实验验证化合物结合位点。结果与结论设计并合成了14个吲哚并五元环化合物(C01~C14)以及3个双吲哚化合物(C15~C17),结构均经1H-NMR、13C-NMR和HRMS谱确证。体外激酶活性测试结果表明,化合物C15在体外对CDK2激酶活性的抑制能力较强,其IC50值为10.4μmol·L-1;在人肝微粒体代谢稳定性测试中,化合物C03和C15的半衰期分别达到186.4 min和137.6 min,是先导化合物EF-3-006(12.7 min)的15倍和11倍。

关键词

CDK2 / 变构调节 / 抑制剂 / 代谢稳定性 / 骨架跃迁

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新型CDK2变构小分子抑制剂的设计、合成、活性及代谢稳定性研究[J]. 中国药物化学杂志, 2025, 35(05): 333-346 DOI:10.14142/j.cnki.cn21-1313/r.2025.05.001

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