2021―2022年川渝部分地区PRRSV分子流行病学及ORF5遗传特征分析

摘要

为了解我国川渝地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)的流行情况及分子特征，本试验以RT-PCR方法对2021―2022年间收集的来自川渝地区的临床样本进行PRRSV检测，并进一步对阳性样本的ORF5基因进行测序分析，探究其流行现状以及遗传变异情况。结果显示，川渝两地PRRSV阳性率为20.5%(40/195),其中四川PRRSV阳性率为18.1%(15/83),重庆为22.3%(25/112)。对其中23份阳性样本的ORF5基因分析显示，所获PRRSV均为基因Ⅱ型，包含谱系1、3、5和8,以NADC30类毒株为主；其中四川地区毒株与上海、辽宁、湖南等地区毒株存在较近的亲缘关系，重庆地区与当地毒株的同源性较高；与目前临床中使用的疫苗毒株比较，发现23株临床样本ORF5序列中有3个B细胞表位和1个T细胞表位与疫苗株存在较大差异。本试验结果表明PRRSV感染在川渝部分地区仍较为严重，美洲型NADC30类毒株是当前流行的优势毒株，且与疫苗株存在一定的变异，该结果对川渝地区PRRSV的防控具有借鉴意义。

关键词

猪繁殖与呼吸综合征病毒 / 分子流行病学 / ORF5基因 / 遗传变异分析