传染性法氏囊病毒超强毒株全基因组克隆与序列分析

摘要

为了解致贵州省某鸡场幼鸡死亡的传染性法氏囊病毒(infectious bursal disease virus, IBDV)GZGY2022分离株的基因组特征、遗传变异及毒株类型，本试验设计引物对其进行全基因组的扩增、克隆、测序，遗传演化和毒株类型分析。结果显示，扩增IBDV全基因组的A、B片段分别为3 260、2 827 bp,分别编码VP2～VP5、VP1基因。该毒株A、B片段与VvIBDV毒株核苷酸序列同源性分别为96.2%～98.7%、87.7%～98.9%,均与NN1172株同源性最高，与其他毒株同源性分别为83.1%～94.7%、90.1%～91.0%。遗传演化及毒株类型结果显示，IBDV毒株按抗原及毒力主要分为6个分支，该毒株A、B片段均聚类在VvIBDV分支，根据新基因型分类方法，该毒株为A3B3基因型。氨基酸序列分析结果表明，该毒株A、B片段分别有3、7处独有的氨基酸位点变异，全基因组编码区与超强毒株有13处一致且独有的特征性氨基酸位点。A片段的VP2序列与超强毒株有19处相同的特征氨基酸，其中高变区222A、242I、253Q、256I、279D、284A、294I、299S是超强毒株的特征性的氨基酸位点，七肽区序列SWSASGS与强毒株一致；B片段的VP1序列与超强毒株有10处相同的特征氨基酸，其中61I、145T、287A是超强毒株的特征性的氨基酸位点，777～782核苷酸序列为GGTGCC,未能形成KpnⅠ限制性内切酶位点，结合三联体位点145/146/147(TEG),则B片段与NN1172株一致，其毒力稍弱于B2型VvIBDV毒株。重组分析结果显示，该毒株序列无断裂和重组位点，未发生重组事件。结果表明，GZGY2022株属于A3B3型非重组超强毒株，特殊氨基酸位点均与VvIBDV分子特征相符。

关键词

传染性法氏囊病毒 / 超强毒株 / 全基因克隆 / 序列分析