新疆地区鹅星状病毒的分离鉴定及全基因组序列分析

摘要

为了解新疆和田地区鹅星状病毒(goose astrovirus, GAstV)的感染情况和分子遗传学特征，无菌采集和田县、于田县和皮山县3个鹅场死亡雏鹅的内脏及肛拭子，通过RT-PCR对GAstV进行检测；应用LMH细胞进行病毒分离鉴定，并对分离株进行全基因组测序与遗传特征分析。结果显示：GAstV在上述地区的总阳性率为11.25%(65/578);通过病毒分离鉴定出2株GAstV,命名为GAstV/XJHT-1和GAstV/XJHT-2。序列测定显示2株病毒的基因组长为7 190、7 125 bp;全基因组同源性分析显示2个分离株均与GAstV-1和GAstV-2的同源性均高于95%,与其他来源(鸡、鸭、火鸡)的同源性为54.1%～61.5%。遗传进化分析显示，分离的GAstV与河南和安徽的GAstV分离株遗传距离较近，表明分离株GAstV可能源于上述两地引进的雏鹅苗或鹅蛋。本试验为进一步研制疫苗或防控产品提供了依据。

关键词

鹅星状病毒 / 分离鉴定 / 全基因组测序 / 同源性 / 遗传进化