转录组揭示产气荚膜梭菌毒素诱导猪IPEC-J2细胞损伤中关键基因和通路

摘要

仔猪腹泻是由产气荚膜梭菌毒素引发的肠道疾病，本研究旨在通过研究与仔猪腹泻相关的关键基因和通路，揭示其对IPEC-J2细胞的损伤机制。使用产气荚膜梭菌毒素处理IPEC-J2细胞，并进行了转录组测序。通过分析差异表达基因的GO功能、KEGG通路和蛋白互作网络，确定了细胞损伤中的关键基因和通路。结果显示，相对于对照组，损伤组共检测到460个基因，其中419个基因上调，41个基因下调。KEGG分析进一步发现，Influenza A和NOD样受体信号通路较为显著，蛋白互作网络分析筛选出了8个核心基因的子网络，它们之间呈正相关，这些基因主要注释在Influenza A和NF-kappa B等信号通路上，实时荧光定量PCR(qRT-PCR)试验进一步证实了RNA-seq测序结果可靠。产气荚膜梭菌毒素对猪IPEC-J2细胞的损伤主要涉及Influenza A、NOD样受体信号通路以及NF-kappa B等通路，MX2、MX1、DDX58、IFI44、ISG15等基因通过关键信号通路可能在猪小肠抵产气荚膜梭菌毒素过程中发挥了重要功能。这为进一步研究产气荚膜梭菌毒素引起仔猪腹泻的机制提供了新的见解。

关键词

产气荚膜梭菌毒素 / 转录组 / IPEC-J2细胞 / 通路

基金资助

山西省基础研究计划资助项目(202103021224323);; 吕梁市科技重点研发资助项目(2020NYGG82)