山羊地方性鼻内肿瘤病毒安徽株全基因组序列分析

李翎旭, 王珍, 郭文晴, 林子彦, 常广军, 姚大伟

doi:10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.11.05

中国兽医学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (11) : 2341 -2347. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.11.05

山羊地方性鼻内肿瘤病毒安徽株全基因组序列分析

李翎旭, 王珍, 郭文晴, 林子彦, 常广军, 姚大伟

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摘要

获得安徽地区2株山羊地方性鼻内肿瘤病毒(enzootic nasal tumor virus-2,ENTV-2)全基因组序列，分析ENTV-2基因的遗传多样性。采集安徽某羊场6只患地方性鼻内腺癌(enzootic nasal adenocarcinoma, ENA)的山羊鼻腔分泌物和血液样品，采用Trizol法提取总RNA,去除其中DNA干扰完成两步法反转录，PCR检测病料中的ENTV-2。选择其中2只山羊的阳性样品，采用5对引物扩增ENTV-2全基因组序列，测序拼接后上传NCBI数据库，与数据库中序列进行比较分析并构建遗传进化树。本研究在6只病羊鼻腔分泌物样品中均可检测出ENTV-2,而血液中不能检出。ENTV-2基因全长约7 400 bp,分别命名为ENTV-2AH1(DDBJ登录号：LC762616)和ENTV-2AH2(DDBJ登录号：LC762617),序列分析显示与国内福建株(ENTV-2FJ)、广西株(ENTV-2-DA0)同源性分别为99.2%、99.1%,并且处于同一进化分支。本研究首次在安徽地区检测到山羊地方性鼻内肿瘤病毒，获得了ENTV-2全基因组序列，有助于进一步研究国内ENTV-2遗传多样性。