1株类NADC30 PRRSV三谱系重组株的分离鉴定及遗传分析

摘要

2018年6月黑龙江佳木斯某猪场的母猪出现了大量流产，随后该场的断奶仔猪在35日龄左右开始出现持续高烧症状，部分猪体温超过41.5℃。为确定此次疫情的病因，本研究对来自本养殖场送检的63份临床样品进行检测。结果显示，63份样品中有60份样品呈现猪繁殖障碍与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)抗原阳性。随后将PRRSV抗原阳性病料接种于非洲绿猴胚胎肾细胞(Marc-145),盲传3代后，进行IFA(indirect immunofluorescence assay),结果显示，成功分离获得1株PRRSV,命名为HLJ38株。随后对HLJ38株进行了全基因组测序，并利用生物信息学软件对其基因组进行了详细分析，结果显示HLJ38株Nsp2基因的推导氨基酸序列中存在3处、共计131(323～433 aa、483 aa和504～522 aa)个氨基酸的缺失，符合类NADC30 PRRSV的分子遗传标志；进化树分析结果显示，HLJ38与GenBank中的类NADC30 PRRSV同属于谱系1亚群，与国内代表毒株CH-1a、HuN4亲缘关系较远，其核苷酸同源性仅为85.2%和84.6%;重组分析结果显示，HLJ38是1株重组的类NADC30 PRRSV,且重组的基因片段来源于多个毒株，其中1～201 nt片段由VR2332毒株提供，而6 641～8 061 nt来源于HP-PRRSV毒株。结果表明，该猪场此次疫情的原因可能是由不同谱系间PRRSV毒株发生重组所致，重组后的流行毒株不仅具有一定的致病性，而且现有的商品化疫苗对其交叉保护性较弱；不同谱系间的重组增加了PRRSV的基因多样性，也加剧了猪场PRRS防控的难度。因此，有必要持续监控猪场中PRRSV的流行动态，及时采取有效措施，遏制PRRS疫情的扩散。

关键词

猪繁殖与呼吸综合征病毒 / 类NADC30 PRRSV / HLJ38 / 重组分析