从河南省猪群中鉴定出PRRSV1病毒感染

摘要

为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒种1(porcine reproductive and respiratory syndrome virus 1,PRRSV1)在河南省的流行情况，本研究对河南省部分规模化猪场临床病料进行分子流行病学调查与病毒分离鉴定。利用PRRSV1 ORF5基因特异性引物进行RT-PCR检测与序列测定，结果共检测出PRRSV1阳性样品8份，获得ORF5基因序列6个，全基因序列1个。利用PAM细胞成功分离出1株PRRSV1,命名为HENZMD-10。对分离毒株基因遗传变异分析，获得的6个ORF5基因均为PRRSV1,分离毒株ORF5基因遗传变异较大，遗传进化树上分属于不同的分支。其中，HENJZ-11、HENJY-7、HENJY-8遗传进化距离较近，分属于同一分支。HENZMD-10分离株基因组全长为15 071 bp,核苷酸序列比对与LV毒株核苷酸相似性为89.1%;与PRRSV2 ATCC-VR2332毒株核苷酸相似性为62.1%;与美国NADC30毒株核苷酸相似性为61.5%;与国内JXA1毒株核苷酸相似性为61.6%。全基因组遗传进化分析显示，HENZMD-10与国内分离PRRSV1毒株NVDC-NM1-2011、LNEU12和FJEU13毒株的遗传距离较近。结果表明，本试验通过对河南省PRRSV1的分子流行病学调查以及病毒全基因遗传进化分析，成功分离1株PRRSV1,为PRRSV1在国内的流行动态及其防控提供一定的临床指导意义。

关键词

PRRSV / PRRSV1 / ORF5基因 / 全基因测序 / 遗传进化分析